Creo un rectángulo, cambio las unidades a cms, voy a la barra de propiedades y cambio las medidas por ejemplo a 10 cms x 10 cms para convertirlo en cuadrado perfecto, PERO la orden no la ejecuta en el rectángulo creado sino que crea otro con esas medidas, cómo hago para que no suceda esto?

primero que nada ¿que version tienes? en versiones anteriores existia una opcion "aplicar a duplicado" en la barra Transformar que si esta activa cuando le cambiabas el tamaño lo aplicaba a un duplicado, es decir, creaba uno nuevo.

Tengo corel version 12, cual es la "barra transformar"??

Si haces click con el boton derecho sobre una barra cualquiera, te aparece un menu, eliges "Transformar" y a final de dicha barra hallaras el icono de "aplicar a duplicado"