Levanto este mensaje por si nadie lo hubiera leído y reitero mi pregunta: una vez que se haya ordenado el listado de tipografías y agrupado por dif categorías: es posible guardar y conservar dicha configuración?

A esta altura de los acontecimientos -y ya con nuevo Papa- creo que nadie le da mucha bola al Font Navigator. La pregunta original sigue sin respuesta. Evidentemente nadie lo usa.
Gracias igual por los que se preocuparon.

Bueno, comento que intenté y organicé las tipografías en una carpeta aparte y me encuentro que algunas son copiables y otras son instalables. Es decir que las que son instalables no las reconoce "copiadas" el Font Navigator.

Mo entiendo muy bien a que te refieres. Todas las fuentes son copiables e instalables, a menos claro, que la fuente esté dañada. De odas formas, si tienes grupos creados siempre tienes la opcion de copiar las fuentes directamente desde FotNavigator, ademas de la opcion que ya vimos de copiar la carpeta de los grupos. Abres un grupo, seleccionas todas las fuentes del grupo y aprietas Ctrl+C, eso te copia las fuentes a una carpeta, te preguntara si es una carpeta ya existente o deseas crear una nueva.

Algunas tipografías clásicas -como por ej. Shelley Alegro- copiada no la reconocía. Tuve que reiniciar el equipo y recién allí la reconoció. No se a qué se debió. Pero ya está solucionado. De todos modos resulta tedioso el manejo de fuentes con el FN ya que si copio/activo una carpeta entera estaría probablemente excediendo el número de fuentes que FN tolera para un buen funcionamiento; y si copio/activo solo algunas fuentes de determinada carpeta después me costaría tiempo ubicar que fuentes debo desinstalar. Espero se entienda.

resulta tedioso el manejo de fuentes con el FN ya que si copio/activo una carpeta entera estaría probablemente excediendo el número de fuentes que FN tolera para un buen funcionamiento; y si copio/activo solo algunas fuentes de determinada carpeta después me costaría tiempo ubicar que fuentes debo desinstalar. Espero se entienda.