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Confirmado. No las guarda por mucho que le des a Guardar preferencias.
Nunca comprenderé como arreglan unas cosas y estropean otras.
No se cambian ni cambiando las opciones en el registro de windows.
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Bien ya he encontrado la forma.
1. Seleccionas la herramienta "Cota" paralela u horizontal/vertical.
2. Sin pinchar en el documento se desactiva la opción "Visualizar unidades" pues de lo contrario no te deja tocar las unidades.
3. Ahora si se activa la casilla de las unidades. La cambias y guardas la configuración.
4. Sin pinchar en el documento se activa otra vez la opción "Visualizar unidades" pues de lo contrario se queda desactivado por mas que lo guardes.
Todo esto hay que hacerlo sin pinchar en el documento para que te salga un cuadro de confirmación.
Muchas Gracias no usos cotas pero es bueno saberlo